Когда Рю возвращается в места своего обучения, дабы отдать последнюю дань своему учителю Гоукену, его начинают мучить страшные воспоминания об убийце учителя. Стремясь стать истинным мастером боевых искусств, Рю начинает совершенствоваться в навыках уличного боя и пытается избавиться от ужасающего наследия Темной Хадоу. Но главной проверкой его вновь обретенных навыков станет судьбоносное столкновение с его заклятым противником, Гоуки.

Рассказ о школьных буднях Канэ Химуро, Каэдэ Макидэры и Юкики Саэгусы.

Во время Великой войны существовала элитная группа воинов, которым не было равных в бою. Их называли нинку, и только благодаря им была одержана победа над империей. Опасаясь влияния и силы нинку, армия победителей объявила на них охоту. Скрываясь от преследования, воины нинку появляются в одном из маленьких городков, решив поработать вышибалами, чтобы хоть как-то свести концы с концами.

С древних времен идет борьба между божествами из других миров. Альпинист Вицумаса в Гималаях находит что-то необычное. В пещере среди гор он находит древний обелиск Рыцарей Зодиака и ещё некоего раненого воина и новорожденную девочку. Как оказалось это девочка воплощение богини Афины. Воин перенес ее на Землю, чтобы спасти, но он умирает. Саори росла в семье Вицумаса до шестнадцати лет и совершенно не знала о своих возможностях. Но в день своего шестнадцатого дня рождения узнает о своей уникальной силе, которая называется «космо», ее она получает с разных уголков Вселенной. С помощью этой силы и поддерживается мир на нашей планете. Борьба за богиню Афину шла много тысячелетий, но на ее стороне сражаются воины Зодиака. Но вскоре Афине будет грозит большая опасность. Смогут ли Рыцари Зодиака спасти ее?

После окончания сериала проходит совсем немного времени. Боевые действия прекращены. Считают, что Юрико и Акито пропали, или даже погибли. Обновленный Надесико занимается патрулированием, у него новый капитан (который до этого был штурманом). Несмотря но окончание войны оружие не пылится – после войны развелось огромное количество террористов и преступных организаций. Одна из них является очень сильной – им удалось найти новую технологию перемещения в пространстве любых объектов на любые расстояния. Самым странным является то, что технология связана с Юрикой и Акитой.

Земляне вводят в эксплуатацию новый тип боевого робота под кодовым названием «Доминион», ещё не догадываясь о смертельной угрозе, которая вскоре нависнет над человечеством. Кира Ямато и его команда решают вмешаться, пока не стало слишком поздно.

В Красном море Кира Ямато и его команда сталкиваются с новой угрозой.