«КотоПёс» рассказывает о забавных невзгодах уникального создания с двумя головами на разных концах туловища. КотоПес - это странный гибрид кошки и собаки, живущий в абсурдном, загадочном мире, наполненном удивительными персонажами, парадоксальными событиями и безумными приключениями. Кот и Пёс - верные друзья, невзирая на их противоположные привычки. Все кошки - чистюли. Собаки же - разгильдяи и грязнули. Кошки привередливы. Собаки едят всё подряд. Кошки обожают понежиться на солнышке. Собаки, увидев лужу, спешат в нее залезть. Кот и Пёс любят друг друга, но, несмотря на это, полетят клочки по закоулочкам!

Непохожим на других всегда живется тяжко – в этом на горьком опыте убедилась Харука Котоура, с детства слышащая чужие мысли. Быть рядом с человеком, для которого ты словно открытая книга – нелегкое испытание. Даже родная мать его не выдержала и сбежала, бросив «чудовище» на попечение деда. Легко предсказать реакцию окружающих, когда те узнавали, с кем их свела судьба. Неудивительно, что Харуке приходилось часто менять учебные заведения, пока в 15 лет она не пришла в очередную старшую школу. Там девушка и поняла, наконец, что свет не без добрых людей! Отнюдь не все вокруг нас – трусоватые эгоисты, что любят только себя. Например, Ёсихиза Манабэ куда больше любит девушек, а по богатству фантазии парень (к ужасу Котоуры) – просто гений. Он и другом Харуки стал, потому что мыслей не стесняется: ведь что естественно, то не безобразно! Для Юрико Мифунэ, президента школьного клуба эсперов, Котоура стала ответом на вопрос, который она долго ждала, у ее загадочного помощника Мурото свои мотивы, а для местной красавицы Хиёри Моритани новенькая стала злейшей подругой и лучшей соперницей… или наоборот? В общем, это и называется нормальной жизнью!

Действие происходит в вымышленной столице Мегакэтсити, населяют которую главным образом антропоморфные животные из семейства кошачьих, известные как кэтсы. Ченс Фёрлонг и Джейк Клоуcон — члены военизированной группировки в Мегакэтсити, называемой Энфорсеры. Во время преследования Дарк Кэта, их реактивный самолёт разбился, упав на штаб Энфорсеров. Из-за этого несчастного случая командующий Ферал отстранил их от выполнения служебных обязанностей. Ченс и Джейк должны были работать на свалке военных отходов до возмещения причинённых ими убытков. Используя хлам со свалки, они построили реактивный истребитель Турбокэт и приступили к патрулированию Мегакэтсити уже в качестве Котов быстрого реагирования.