«Дети шпионов: критическая миссия» - это ответвление от оригинальной сюжетной линии серии фильмов, представленное в формате мультипликации. Мультсериал о подготовке детей в шпионской академии. Главные герои - мальчишки и девчонки, которые мечтают защищать мир от злодеев. Последние же всегда стремятся использовать самые смертоносные виды вооружения, чтобы нанести вред простым жителям Земли. Взрослые шпионы бессильны перед мегазлым антагонистом. Теперь слово за детьми!

После разрушительной войны люди решили отказаться от оружия, и главным способом решения конфликтов стал обман. Шпиону по имени Клаус поручено обучить семь девушек, чтобы они стали агентами, способными справиться с любой задачей. Беда в том, что его подопечные совершенно безнадёжны: они некомпетентны и сами напуганы перспективой отправиться на невыполнимую миссию.

Большинство жителей Парижа даже не подозревает, что они обязаны своим покоем и благополучием троице храбрых пингвинов. Ловкий малыш Рок, несокрушимый силач Роборобо и гордый красавец Тексча защищают любимый город от особо опасных преступников. Их главный противник – большой коварный кот, который вместе со своей бандой приспешников пытается устроить хаос на парижских улицах. Запустить ракеты в Эйфелеву башню или забросать город гигантскими бильярдными шарами – это его обыкновенные планы на день. Но друзья-пингвины, работающие на секретное шпионское агентство, всегда готовы дать отпор злодеям. С помощью новейших гаджетов и своих личных талантов спецагенты в деловых костюмах и стильных очках выполняют самые немыслимые миссии. У них не всё и всегда идет по плану, но главная сверхспособность этой неугомонной троицы – умение импровизировать.

Для выполнения новой миссии секретный агент должен завести поддельную семью. Но он и не подозревает, что его фиктивная жена — наёмная убийца, а удочеренная маленькая девочка — телепат, которая хочет, чтобы приёмные родители, несмотря ни на что, действительно были вместе.