Некая актриса просит Когоро Мори защитить драгоценный «Сапфир судьбы», который Кайто Кид зарёкся украсть. В день кражи Конан разоблачает Кида и преследует его, но тому удаётся уйти. В благодарность за защиту драгоценности, актриса приглашает семью Мори и их друзей в Саппоро. Но на самолете происходит преступление, которое предстоит распутать Конану, даже не подозревающему, что в этот момент всем пассажирам грозит огромная опасность.

Сюжет данного произведения, рассказывает нам о том, как парень по имени Конан вместе с семьей Мори и Юными Сыщиками по приглашению Сузуки Соноко, отправляются в превосходное плавание на большом круизном лайнере «Афродита», который был построен корпорацией «Ясиро Групп». Но, к большому сожалению, на борту корабля происходит несколько убийств - кто-то явно нацелился на руководителей корпорации. Как связаны данные убийства с великим кораблекрушением, которое произошло аж пятнадцать лет тому назад? И почему нападению подверглась именно Сонока? Наконец, удастся ли Конану со своими товарищами благополучно покинуть этот злополучный корабль невредимыми? Ведь он явно напоминает таинственную и смертоносную ловушку. В общем, все это и многое другое, мы узнаем, при просмотре данной картины.

Неуловимый вор Кайто Кид планирует украсть драгоценный камень «Слеза Артемиды», который находится в отеле на удалённом острове. Конан Эдогава и его друзья, также находящиеся на этом острове, всеми силами стремятся остановить Кида.

Диана приглашает Конана Эдогаву и его друзей посетить Лондон. После возвращения в Японию Аи Хаибару начинает разыскивать подозрительный мужчина в чёрном, а позже выясняется, что Ая выглядит точь-в-точь как известная киноактриса Грэйс Аихара.

Профессор Агаса просит Конана Эдогаву посетить бейсбольную игру, в которой участвует Минаэ — единственная девушка в команде. Минаэ приходится нелегко, а тренер считает, что ей не хватает уверенности в себе. Направляясь на скамейку запасных, она спотыкается о бейсбольную биту, которую легендарный игрок Мацуи Хидэки когда-то воткнул в землю. Согласно легенде, любой игрок, который сможет достать биту из земли, приобретёт силу настоящего бейсболиста.

Знаменитый вор Кайто Кид заявляет, что в ближайшее время он собирается украсть особый меч, который хранится в додзё семьи Минэ. Детектив Конан Эдогава, Когоро Мори и остальная команда прибывают на место, где встречают Яибу Куроганэ. Вместе они готовятся помешать Киду осуществить задуманное, но Конан начинает подозревать, что здесь что-то не так.

Конан Эдогава и его команда приглашены на вечеринку, которая состоится на вилле инспектора Ниндзабуро Сиратори. Изюминкой вечера должна стать знаменитая коллекция вин инспектора, и особенно его самый дорогой винтаж, который будет подан гостям. Однако в кульминационный момент Сиратори обнаруживает на полу разбитую бутылку, а виновник определённо находится среди приглашённых.

Конан и Ран решают навестить в Осаке Хэйдзи и Кадзуху. Во время прогулки по городу они встречают детей, которые ищут своего пропавшего друга.

Известный вор Кайто Кид планирует украсть у королевы самый большой топаз Европы «Мать кристаллов», воспользовавшись задержкой её поезда. Но Киду придётся сильно попотеть, поскольку драгоценный камень хорошо спрятан в одном из вагонов. В этом же поезде находится и детектив Конан Эдогава, который ожидает появления Кида.

Выполняя школьное задание, юная команда детективов начинает изучать жизнь Мори Когоро. Ему поручают следить за бойфрендом своей дочери влиятельные люди, но прямо на глазах у Мори парня похищают. Юная команда детективов решает помочь Мори Когоро в его деле.

В детективное агентство Конана Эдогавы поступает звонок от шантажиста, но выясняется, что звонивший ошибся номером. Голос преступника напоминает Конану его старого друга и детектива Хэйдзи Хаттори из Осаки. Вместе они решают раскрыть это дело и найти украденный драгоценный камень, за которым также охотится известный вор Кайто Кид.

Профессор Агаса похищен. Конан Эдогава и его друзья начинают собственное расследование.

Соноко пишет сценарий к благотворительной постановке, но никак не может придумать конец. Юная команда детективов вместе с Ран берется ей помочь

История детства Конана Эдогавы и его друзей, которые 10 лет назад не приняли противоядие APTX 4869. Их мечта — стать детективами.