Организация под названием «Агентство Д» создана осенью 1937 года в качестве независимого армейского подразделения по личной инициативе подполковника Юки. По слухам, Юки сам в прошлом был хорошим агентом и добыл у врага немало секретов, пока его не предал союзник. До побега из плена подполковника жестоко пытали, чем объясняется отсутствие левой руки и то, что он ходит с тростью, прихрамывая на левую ногу. Получив прозвище «Властелин тьмы», Юки учит солдат по принципам, которые сильно отличаются от традиционной армейской мудрости. Игнорируя армейские ранги, одежду и поведение, он учит своих подопечных быть незаметными и невидимыми, а также берёт кандидатов издалека, тренируя специалистов нескольким языкам, взлому и мастерству скрытности. Под фальшивыми личинами его агенты выполняют миссии по всей Азии. Haadoboirudo

Субару Нацки попадает в параллельный мир, где его спасает прекрасная серебряноволосая девушка. Чтобы отблагодарить её, он решает следовать за ней, вот только девушка несёт бремя, которое Субару не в состоянии даже представить. Враги постоянно нападают на героев, и в итоге... их обоих убивают. И тут-то Субару обнаруживает, что в момент смерти может отматывать время назад к тому мгновению, когда попал в параллельный мир, причём помнит всё лишь он один.

История расскажет об ученице средней школы Мачи Амаядори, которая является жрицей медвежьего бога. Помимо работы в святыни, она заботится о медведе Нацу, который обитает глубоко в горах в северном регионе Японии — Тохоку. Этот медведь умеет разговаривать, является опекуном и телохранителем Мачи. С помощью Нацу девочка хочет набраться знаний, которые позволят ей в конце концов уйти из храма, чтобы зажить нормальной городской жизнью. После того как Мачи сообщает Нацу, что отправляется учиться в городскую школу, он дает ей несколько указаний и советов, которые помогут ей справиться с городской жизнью.

Под поверхностью планеты простирается неведомый мир под названием — Эндра. Шун Асанага — обычный пятнадцатилетний подросток однажды попадает в неизвестный подземный мир. Все произошло после того, как Шун пришел на работу к своему отцу и нашел там необычный кристалл. Но стоило Шуну лишь коснуться его, как тот перенес юношу в Эндру. Там Шуна выбрасывает прямо в тюремную камеру, где он встречает принца Эмилио Лангхейма, который уже какое-то время сидит в камере за попытку государственного переворота. Эмилио пытался свергнуть нынешнего короля с престола ради мести, однако эта попытка потерпела неудачу, и принца заточили в темницу. Так встречаются два парня — Шун и Эмилио. Один пытается найти обратный путь в свой мир, другой ищет мести. Сможет ли каждый из них достичь своей цели?

История происходит в наши дни, но только люди с суперспособностями тут обычное дело по всему миру. Мальчик по имени Изуку Мидория не обладает способностями, но у него есть мечта стать супергероем.