Действия истории разворачиваются в альтернативной вселенной. В ней у определенного количества подростков в возрасте 12-16 лет появляются разнообразные паранормальные способности. Одним из таких подростков является парень по имени Ю Отосака. Несмотря на наличие сверхспособностей, парень живет обычной школьной жизнью и свои «таланты» на показ не выставляет, пока в один из прекрасных дней не встречает девушку по имени Нао Томори.

Однажды в не столь отдаленном будущем на Землю обрушилась новая угроза, и пришла она не из космоса и не из лабораторий халатных ученых, а прямиком из квартала Токио, Гинзы. Точнее говоря, из открывшегося в Гинзе портала в параллельный мир, откуда через образовавшиеся врата хлынули существа, будто сошедшие со страниц фэнтези-романов. Были среди них и странные чудища, и бравые рыцари, и представители разнообразных волшебных рас – словом, таких гостей в нашей более-менее упорядоченной реальности никто не ждал. Впрочем, чудища чудищами, рыцари рыцарями, а научно-технический прогресс человечества – это не шутки. Отразив атаку пришельцев, люди призадумались о том, каков параллельный мир, спустя некоторое время после данного инцидента японское правительство решило провести контрразведку. Отобрав солдат из сил самообороны, оно отправило получившиеся отряды сквозь портал, дабы изучить мир по ту сторону врат. Одним из командиров оказался Юджи Итами – хронический отаку, которому, похоже, наконец выпал шанс употребить наилучшим образом свои таланты.

Шестнадцать лет назад в Японии был принят закон «О воспитании детей и общественном порядке», запрещающий любое поведение, выходящее за рамки человеческой нравственности. В результате этого в обществе возник культ добродетели и морали, возникли даже особые школы. В одно из таких учебных заведений, пропагандирующих благопристойность и вежливость, и поступает Таникучи Окума. Но кто же мог предположить, что в этом оплоте порядка действует террористическая организация «SOX», специализирующаяся на безнравственных актах вандализма. Шантажом и обманом Таникучи заставляют присоединиться к этой системе. Теперь он вынужден участвовать в безнравственных атаках на Анну, первую ученицу школы и президента студсовета. Вскоре ситуация неожиданно осложняется, когда новоявленный член террористической организации влюбляется в свою жертву.

В городе Кирищина, особой экономической зоне Токио-4 (это одна из новых японских префектур на Марсе), расположена корпорация «Кирищина» – крупная компания, известная в первую очередь благодаря своим аэрокосмическим разработкам. Кроме этого компания развивается в самых разных областях, захватывая всё новые рынки, и среди прочего владеет частной школой, которая так и называется – Старшая школа Кирищинской академии науки и технологий. А в этой школе есть один очень особенный спецкласс. Днём его ученики посещают занятия вместе со всеми остальными, а после занимаются ключевыми проектами компании, разрабатывая прототипы новых ракет. Называется всё это Класс образовательных разработок при Департаменте передовых технологический разработок корпорации Кирищина (сокращенно – A-TEC). Руководит им молодой гениальный инженер Кайто Сера. Действие начинается того, что в класс переводится новый ученик, но когда школьники готовятся встречать новичка, выясняется, что его (или её) похитили на пути к Марсу. Определив, что справляться с этим кризисом им предстоит самостоятельно, Кайто и его подопечные решают осуществить беспрецедентную спасательную операцию...

История начинается в одной из средних школ, где происходят несколько загадочных убийств. В это же время Кобаяши, ученик этой школы, встречает гениального сыщика по имени Акэчи, который прибыл сюда для расследования. Кобаяши проявляет интерес к Акэчи и, несмотря на упорную заботу своего друга Хашибы, добровольно становится помощником юного Коломбо, которого можно назвать поистине неординарной личностью.