Очаровательный и смешной пес по кличке Скуби Ду вместе со своим хозяином Шеги и друзьями: Вельмой, Дафни и Фредди постоянно попадают в удивительные приключения. Они расследуют мистические случаи похищения людей и собак, связанные с призраками, заброшенными замками и затерянными сокровищами. И не смотря на то, что Скуби Ду ужасно боится привидений, и думает исключительно о сухариках и собачьих консервах, он всегда оказывается победителем и успешно распутывает все эти загадочные происшествия.

В будущем свое место среди достижений инновационных технологий займет недоработанная система «Кизуна» (яп. 絆 — «связь»). Смысл ее в том, что, если человек, в которого вживлен «Кизуна»-чип, получает ранение, другие люди с такими же чипами оказываются ранены идентичным образом. В буквальном смысле связывая людей через раны, создатели системы хотят достичь мира во всем мире. Людей-обладателей чипа «Кизуна» называют кизнайверами. События аниме развиваются в вымышленном японском городе Сугомори-Сити. Город этот непростой, а возведенный на мелиорированных землях, и население которого стремительно сокращается. Недавно переведенная в новую школу Норико Сонозаки сообщает своему однокласснику, Кацухире Агате, что планы на его летние каникулы немного подкорректировали — он избран в качестве кизнайвера. С этих пор юноша будет связан с одноклассниками-кизнайверами. Но есть одна проблема: все они ведут непредсказуемый образ жизни, что в корне не устраивает нелюдимого Кацухиру.

В этом пародийном сериале была предпринята попытка скрестить вестерн, меха и роуд-муви. Но хотя обыгрывание штампов занимает значительную часть сюжета, а в результате получилась захватывающая история про поиски и месть, спасение человечества и свободу выбора.