События происходят в мире, параллельном миру «Ночи схватки», в котором Великий Грааль загадочным образ исчез из Фуюки после Третьей Войны Святого Грааля. Спустя много лет клан магов Иггдмилленния открыто заявляет о своём выходе из Ассоциации Магов и о том, что именно в их руках находится Грааль. Тем временем в городе Трифас две противоборствующие стороны сталкиваются в битве за право владеть священной реликвией. Чёрная фракция, члены которой являются магами семьи Игдмилления, и Красная фракция — наёмники, отправленные Ассоциацией для того, чтобы вернуть Грааль. С каждой стороны выступают семь слуг и семь мастеров. Сам Грааль призывает слугу класса Рулер в качестве наблюдателя конфликта. Это знаменует начало Великой Войны Святого Грааля.

В академии сожительства Аичи ношение оружия - дело совершенно обычное. Для девушек. В академии даже образовалась дружина из пяти мечниц, которые взяли на себя обязанность по исправлению трудных подростков, которые не смогли прижиться в своей прошлой школе. Номура Фудо, придя в эту академию, надеялся увидеть райский сад из доброжелательных девушек, а получил совершенно обратное. Теперь ему, как и всем парням до него, придётся пройти через процедуру усмирения. Да и мечницам посоветовали обратить на него пристальное внимание, а значит поблажек ждать не стоит. Каков же будет результат?

Такахаси Тэцуо всегда мечтал изучать "полулюдов" - мистических существ с исключительными, не присущими людям качествами. И теперь, когда общество их признало, и они могут больше не прятаться, у него появилась такая возможность. Как среди учеников, так и среди педагогического состава старшей школы, где он работает учителем биологии, оказались полулюды: нас ждет встреча со снежной девой, вампиром, неуклюжей дуллахан, а так же учительницей-суккубом. Сумеет ли молодой учитель не только удовлетворить свое любопытство, но и стать для девочек хорошим наставником