Поставленный по роману Никоса Казандзакиса, фильм рассказывает об Иисусе Христе с очень нетрадиционной точки зрения. Иисус показан сомневающимся и нерешительным. Он понимает, что избран Богом, чтобы нести его Слово людям, но ведь с таким же успехом на его месте мог быть любой другой. Неканоническая трактовка Нового Завета вызвала скандал в клерикальных кругах, и, как это чаще всего бывает, послужила дополнительной рекламой фильму.

Действия фильма разворачиваются в 1327 году на севере Италии, где находится Бенедиктинский монастырь. В этом монастыре происходит несколько загадочных смертей, монах Вильям Баскервильский и молодой послушник Адсо отправляются в этот монастырь, чтобы выяснить – что же там происходит. Вскоре Вильяму становится ясно, что с этим монастырем связанна какая-то тайна, а еще через некоторое время он находится тайную библиотеку монастыря, в которой хранится древний манускрипт. Этот манускрипт является ключом к разгадке тайны, которая витает в Бенедиктинском монастыре.

По реке, петляющей в джунглях, плывет крест, к которому кто-то привязал иезуитского священника. Священник измучен, но ничего поделать он не может. И вот река выносит крест к семидесятиметровому водопаду. Священник вместе со своим крестом исчезает в рокочущих тоннах воды, падающих с головокружительной высоты. Так начинается история о двух людях, которые объединились с одной целью – защитить мирное индейское племя от кровожадных колонизаторов, намеревающихся уничтожить индейцев и присвоить себе их законные земли.

Хома Брут, остановившийся на ночлег в небольшом хуторе, лицом к лицу сталкивается с ведьмой. Хома находит в себе силы убить ведьму, но, умирая, ведьма превращается в молодую девушку, которая просит Хому три ночи читать по ней заупокойную молитву. Хома не может отказать девушке, на следующую ночь он приходит к гробу девушки и начинает заупокойную службу и тут… девушка встает из гроба. Защитные круги, которые начертил Хома, защищают его первые две ночи, но на третью ночь вместе с прочей нечестью приходит Вий, от взгляда которого никто не может скрыться.

Габриэль ван дер Маль, дочь известного бельгийского врача, мечтает уехать в Конго, чтобы лечить местных жителей. Приняв постриг в монастыре и получив новое имя — сестра Люк — она прибывает в Конго для работы в госпитале.